24 kwietnia 2008 roku w krypcie kościoła kapucynów w San Giovanni Rotondo zostały wystawione do publicznej czci relikwie Świętego Ojca Pio. Od tego dnia pielgrzymi mogli modlić się przy relikwiach ciała Ojca Pio, wystawionego w szklanym sarkofagu, w tym samym miejscu, w którym do czasu ekshumacji znajdował się grób świętego Kapucyna.

Zakończenie wystawienia ciała Ojca Pio i uroczyste zamknięcie urny z relikwiami miało miejsce w nocy z 23 na 24 września 2009 roku. 24 września 2009 roku o godz. 16.00 ponownie otwarto kryptę dla pielgrzymów, jednak już bez możliwości oglądania ciała Ojca Pio, które zostało schowane w specjalnej trumnie, obłożonej srebrnymi płytami.

19 kwietnia 2010 roku urna z relikwiami Ojca Pio została przeniesiona do krypty w nowym kościele.

Na zdjęciach relikwie Ojca Pio z okresu wystawienia do publicznej czci w przezroczystym sarkofagu - Fotografie br. Paweł Teperski OFMCap